Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ATMQ13315 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC-1.68□□□□□ -2.68
ATMQ13315 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ATMQ13315 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ATMQ13315 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ATMQ13315 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ATMQ13315 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ATMQ13315 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ATMQ13315 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ATMQ13315 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ATMQ13315 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ATMQ13315 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ATMQ13315 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ATMQ13315 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ATMQ13315 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ATMQ13315 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.69□□□□□ -2.68
ATMQ13315 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
ATMQ13315 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
ATMQ13315 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
ATMQ13315 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
ATMQ13315 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
ATMQ13315 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
ATMQ13315 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
ATMQ13315 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.69□□□□□ -2.68
ATMQ13315 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
ATMQ13315 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
ATMQ13315 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
ATMQ13315 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
ATMQ13315 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
ATMQ13315 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC-1.69□□□□□ -2.68
ATMQ13315 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
ATMQ13315 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
ATMQ13315 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
ATMQ13315 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
ATMQ13315 MIR509-1-201ENST00000385265 94 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
ATMQ13315 MIR509-2-201ENST00000390724 91 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
ATMQ13315 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
ATMQ13315 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC-1.7□□□□□ -2.68
ATMQ13315 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
ATMQ13315 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
ATMQ13315 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
ATMQ13315 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
ATMQ13315 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
ATMQ13315 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
ATMQ13315 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
ATMQ13315 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
ATMQ13315 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
ATMQ13315 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
ATMQ13315 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
ATMQ13315 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
ATMQ13315 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
ATMQ13315 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
ATMQ13315 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
ATMQ13315 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
ATMQ13315 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
ATMQ13315 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
ATMQ13315 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
ATMQ13315 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
ATMQ13315 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC-1.71□□□□□ -2.68
ATMQ13315 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
ATMQ13315 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
ATMQ13315 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
ATMQ13315 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
ATMQ13315 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
ATMQ13315 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
ATMQ13315 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
ATMQ13315 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
ATMQ13315 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
ATMQ13315 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
ATMQ13315 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
ATMQ13315 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
ATMQ13315 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
ATMQ13315 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
ATMQ13315 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
ATMQ13315 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
ATMQ13315 MIRLET7A3-201ENST00000362116 74 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
ATMQ13315 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
ATMQ13315 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
ATMQ13315 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-1.72□□□□□ -2.68
ATMQ13315 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
ATMQ13315 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
ATMQ13315 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
ATMQ13315 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
ATMQ13315 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC-1.72□□□□□ -2.68
ATMQ13315 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
ATMQ13315 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.69
ATMQ13315 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.69
ATMQ13315 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.69
ATMQ13315 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC-1.72□□□□□ -2.69
ATMQ13315 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.69
ATMQ13315 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
ATMQ13315 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
ATMQ13315 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC-1.73□□□□□ -2.69
ATMQ13315 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
ATMQ13315 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
ATMQ13315 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
ATMQ13315 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC-1.73□□□□□ -2.69
ATMQ13315 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
ATMQ13315 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
ATMQ13315 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
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