Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC1.18□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
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