Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.61□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC0.6□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
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IFT88Q13099 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.59□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
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IFT88Q13099 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
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IFT88Q13099 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
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IFT88Q13099 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
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IFT88Q13099 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
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