Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
MKRN3Q13064 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
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