Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
STRN3Q13033 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
STRN3Q13033 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
STRN3Q13033 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
STRN3Q13033 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
STRN3Q13033 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
STRN3Q13033 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
STRN3Q13033 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
STRN3Q13033 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
STRN3Q13033 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
STRN3Q13033 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
STRN3Q13033 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
STRN3Q13033 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
STRN3Q13033 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
STRN3Q13033 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
STRN3Q13033 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
STRN3Q13033 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
STRN3Q13033 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
STRN3Q13033 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
STRN3Q13033 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
STRN3Q13033 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
STRN3Q13033 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
STRN3Q13033 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
STRN3Q13033 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
STRN3Q13033 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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