Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-1.32□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC-1.33□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC-1.33□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC-1.35□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC-1.37□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC-1.37□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC-1.38□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC-1.39□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
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