Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
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PTPRDP23468 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
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PTPRDP23468 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC-0.6□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC-0.6□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC-0.6□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
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