Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CTIFO43310 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CTIFO43310 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CTIFO43310 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CTIFO43310 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CTIFO43310 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CTIFO43310 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CTIFO43310 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
CTIFO43310 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CTIFO43310 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CTIFO43310 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CTIFO43310 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CTIFO43310 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CTIFO43310 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CTIFO43310 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CTIFO43310 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CTIFO43310 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CTIFO43310 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CTIFO43310 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CTIFO43310 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CTIFO43310 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CTIFO43310 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CTIFO43310 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CTIFO43310 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CTIFO43310 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CTIFO43310 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CTIFO43310 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CTIFO43310 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CTIFO43310 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CTIFO43310 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CTIFO43310 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CTIFO43310 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CTIFO43310 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CTIFO43310 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CTIFO43310 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CTIFO43310 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CTIFO43310 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CTIFO43310 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CTIFO43310 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CTIFO43310 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CTIFO43310 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CTIFO43310 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CTIFO43310 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CTIFO43310 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CTIFO43310 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CTIFO43310 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CTIFO43310 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CTIFO43310 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
CTIFO43310 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
CTIFO43310 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CTIFO43310 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CTIFO43310 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CTIFO43310 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CTIFO43310 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CTIFO43310 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CTIFO43310 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CTIFO43310 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CTIFO43310 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CTIFO43310 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CTIFO43310 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CTIFO43310 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CTIFO43310 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CTIFO43310 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CTIFO43310 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CTIFO43310 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CTIFO43310 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CTIFO43310 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CTIFO43310 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CTIFO43310 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CTIFO43310 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
CTIFO43310 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CTIFO43310 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CTIFO43310 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CTIFO43310 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CTIFO43310 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CTIFO43310 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CTIFO43310 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CTIFO43310 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CTIFO43310 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CTIFO43310 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CTIFO43310 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CTIFO43310 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CTIFO43310 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CTIFO43310 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CTIFO43310 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CTIFO43310 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CTIFO43310 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CTIFO43310 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CTIFO43310 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CTIFO43310 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CTIFO43310 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CTIFO43310 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CTIFO43310 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CTIFO43310 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CTIFO43310 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CTIFO43310 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
CTIFO43310 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CTIFO43310 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CTIFO43310 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CTIFO43310 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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