Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC1.16□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.6 ms