Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CRXO43186 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CRXO43186 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CRXO43186 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CRXO43186 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.17□□□□□ -2.44
CRXO43186 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CRXO43186 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CRXO43186 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CRXO43186 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CRXO43186 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
CRXO43186 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CRXO43186 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CRXO43186 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CRXO43186 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
CRXO43186 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CRXO43186 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CRXO43186 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CRXO43186 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CRXO43186 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CRXO43186 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CRXO43186 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CRXO43186 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CRXO43186 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
CRXO43186 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CRXO43186 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CRXO43186 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CRXO43186 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CRXO43186 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CRXO43186 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CRXO43186 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CRXO43186 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CRXO43186 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CRXO43186 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CRXO43186 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CRXO43186 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CRXO43186 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
CRXO43186 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CRXO43186 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CRXO43186 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CRXO43186 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CRXO43186 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CRXO43186 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
CRXO43186 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CRXO43186 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CRXO43186 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CRXO43186 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CRXO43186 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CRXO43186 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CRXO43186 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CRXO43186 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CRXO43186 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CRXO43186 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CRXO43186 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
CRXO43186 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CRXO43186 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CRXO43186 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CRXO43186 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CRXO43186 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CRXO43186 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CRXO43186 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CRXO43186 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
CRXO43186 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CRXO43186 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CRXO43186 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CRXO43186 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CRXO43186 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CRXO43186 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CRXO43186 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
CRXO43186 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CRXO43186 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CRXO43186 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CRXO43186 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CRXO43186 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CRXO43186 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
CRXO43186 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CRXO43186 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CRXO43186 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CRXO43186 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CRXO43186 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CRXO43186 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CRXO43186 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CRXO43186 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CRXO43186 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CRXO43186 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CRXO43186 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CRXO43186 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CRXO43186 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CRXO43186 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CRXO43186 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CRXO43186 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CRXO43186 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CRXO43186 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CRXO43186 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CRXO43186 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CRXO43186 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CRXO43186 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CRXO43186 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CRXO43186 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
CRXO43186 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CRXO43186 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.3 ms