Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ERVV-2B6SEH9 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ERVV-2B6SEH9 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.9 ms