Protein–RNA interactions for Protein: A5PLN9

TRAPPC13, Trafficking protein particle complex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC13A5PLN9 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.13□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.1 ms