Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SH3BP1Q9Y3L3 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SH3BP1Q9Y3L3 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SH3BP1Q9Y3L3 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SH3BP1Q9Y3L3 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SH3BP1Q9Y3L3 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SH3BP1Q9Y3L3 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SH3BP1Q9Y3L3 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SH3BP1Q9Y3L3 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SH3BP1Q9Y3L3 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SH3BP1Q9Y3L3 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SH3BP1Q9Y3L3 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SH3BP1Q9Y3L3 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SH3BP1Q9Y3L3 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SH3BP1Q9Y3L3 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SH3BP1Q9Y3L3 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 226.8 ms