Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms