Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
CIPCQ9C0C6 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CIPCQ9C0C6 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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