Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.47□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.47□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC-1.48□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC-1.48□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC-1.48□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC-1.48□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC-1.48□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.49□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC-1.5□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC-1.5□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC-1.5□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC-1.5□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC-1.51□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC-1.51□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC-1.51□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC-1.52□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
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