Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
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