Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4Q7

CNNM4, Metal transporter CNNM4, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM4Q6P4Q7 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CNNM4Q6P4Q7 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CNNM4Q6P4Q7 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CNNM4Q6P4Q7 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CNNM4Q6P4Q7 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CNNM4Q6P4Q7 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNNM4Q6P4Q7 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNNM4Q6P4Q7 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNNM4Q6P4Q7 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNNM4Q6P4Q7 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNNM4Q6P4Q7 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNNM4Q6P4Q7 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNNM4Q6P4Q7 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNNM4Q6P4Q7 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNNM4Q6P4Q7 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CNNM4Q6P4Q7 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNNM4Q6P4Q7 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNNM4Q6P4Q7 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNNM4Q6P4Q7 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNNM4Q6P4Q7 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNNM4Q6P4Q7 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNNM4Q6P4Q7 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNNM4Q6P4Q7 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNNM4Q6P4Q7 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNNM4Q6P4Q7 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNNM4Q6P4Q7 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNNM4Q6P4Q7 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNNM4Q6P4Q7 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNNM4Q6P4Q7 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNNM4Q6P4Q7 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CNNM4Q6P4Q7 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNNM4Q6P4Q7 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNNM4Q6P4Q7 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CNNM4Q6P4Q7 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNNM4Q6P4Q7 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNNM4Q6P4Q7 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNNM4Q6P4Q7 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNNM4Q6P4Q7 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CNNM4Q6P4Q7 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNNM4Q6P4Q7 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNNM4Q6P4Q7 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CNNM4Q6P4Q7 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CNNM4Q6P4Q7 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNNM4Q6P4Q7 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNNM4Q6P4Q7 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNNM4Q6P4Q7 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNNM4Q6P4Q7 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNNM4Q6P4Q7 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CNNM4Q6P4Q7 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CNNM4Q6P4Q7 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CNNM4Q6P4Q7 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CNNM4Q6P4Q7 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CNNM4Q6P4Q7 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CNNM4Q6P4Q7 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CNNM4Q6P4Q7 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CNNM4Q6P4Q7 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CNNM4Q6P4Q7 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CNNM4Q6P4Q7 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CNNM4Q6P4Q7 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CNNM4Q6P4Q7 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CNNM4Q6P4Q7 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CNNM4Q6P4Q7 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CNNM4Q6P4Q7 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CNNM4Q6P4Q7 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CNNM4Q6P4Q7 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CNNM4Q6P4Q7 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CNNM4Q6P4Q7 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNNM4Q6P4Q7 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNNM4Q6P4Q7 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNNM4Q6P4Q7 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNNM4Q6P4Q7 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNNM4Q6P4Q7 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNNM4Q6P4Q7 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNNM4Q6P4Q7 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNNM4Q6P4Q7 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNNM4Q6P4Q7 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CNNM4Q6P4Q7 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CNNM4Q6P4Q7 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CNNM4Q6P4Q7 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CNNM4Q6P4Q7 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CNNM4Q6P4Q7 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CNNM4Q6P4Q7 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CNNM4Q6P4Q7 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CNNM4Q6P4Q7 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CNNM4Q6P4Q7 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CNNM4Q6P4Q7 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CNNM4Q6P4Q7 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CNNM4Q6P4Q7 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CNNM4Q6P4Q7 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CNNM4Q6P4Q7 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CNNM4Q6P4Q7 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CNNM4Q6P4Q7 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CNNM4Q6P4Q7 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CNNM4Q6P4Q7 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CNNM4Q6P4Q7 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CNNM4Q6P4Q7 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CNNM4Q6P4Q7 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CNNM4Q6P4Q7 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CNNM4Q6P4Q7 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CNNM4Q6P4Q7 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.5 ms