Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
ANKRD39Q53RE8 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
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