Protein–RNA interactions for Protein: Q16777

HIST2H2AC, Histone H2A type 2-C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2ACQ16777 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HIST2H2ACQ16777 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HIST2H2ACQ16777 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HIST2H2ACQ16777 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HIST2H2ACQ16777 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HIST2H2ACQ16777 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HIST2H2ACQ16777 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HIST2H2ACQ16777 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HIST2H2ACQ16777 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HIST2H2ACQ16777 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
HIST2H2ACQ16777 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HIST2H2ACQ16777 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HIST2H2ACQ16777 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HIST2H2ACQ16777 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HIST2H2ACQ16777 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HIST2H2ACQ16777 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HIST2H2ACQ16777 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HIST2H2ACQ16777 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HIST2H2ACQ16777 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HIST2H2ACQ16777 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HIST2H2ACQ16777 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HIST2H2ACQ16777 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.4 ms