Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
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