Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
STX1AQ16623 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
STX1AQ16623 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
STX1AQ16623 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
STX1AQ16623 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
STX1AQ16623 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
STX1AQ16623 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
STX1AQ16623 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
STX1AQ16623 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
STX1AQ16623 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
STX1AQ16623 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
STX1AQ16623 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
STX1AQ16623 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
STX1AQ16623 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
STX1AQ16623 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
STX1AQ16623 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
STX1AQ16623 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
STX1AQ16623 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
STX1AQ16623 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
STX1AQ16623 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
STX1AQ16623 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
STX1AQ16623 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
STX1AQ16623 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
STX1AQ16623 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
STX1AQ16623 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
STX1AQ16623 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
STX1AQ16623 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
STX1AQ16623 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
STX1AQ16623 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
STX1AQ16623 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
STX1AQ16623 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
STX1AQ16623 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
STX1AQ16623 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
STX1AQ16623 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
STX1AQ16623 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
STX1AQ16623 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
STX1AQ16623 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
STX1AQ16623 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
STX1AQ16623 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
STX1AQ16623 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
STX1AQ16623 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
STX1AQ16623 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
STX1AQ16623 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
STX1AQ16623 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
STX1AQ16623 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
STX1AQ16623 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
STX1AQ16623 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
STX1AQ16623 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
STX1AQ16623 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
STX1AQ16623 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
STX1AQ16623 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
STX1AQ16623 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
STX1AQ16623 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
STX1AQ16623 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
STX1AQ16623 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
STX1AQ16623 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
STX1AQ16623 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
STX1AQ16623 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
STX1AQ16623 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
STX1AQ16623 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.26
STX1AQ16623 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
STX1AQ16623 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
STX1AQ16623 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
STX1AQ16623 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
STX1AQ16623 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
STX1AQ16623 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
STX1AQ16623 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
STX1AQ16623 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
STX1AQ16623 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
STX1AQ16623 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
STX1AQ16623 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
STX1AQ16623 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
STX1AQ16623 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
STX1AQ16623 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
STX1AQ16623 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
STX1AQ16623 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
STX1AQ16623 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
STX1AQ16623 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
STX1AQ16623 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
STX1AQ16623 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
STX1AQ16623 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
STX1AQ16623 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
STX1AQ16623 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
STX1AQ16623 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
STX1AQ16623 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
STX1AQ16623 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
STX1AQ16623 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
STX1AQ16623 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
STX1AQ16623 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
STX1AQ16623 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
STX1AQ16623 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
STX1AQ16623 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
STX1AQ16623 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
STX1AQ16623 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
STX1AQ16623 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
STX1AQ16623 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
STX1AQ16623 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
STX1AQ16623 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
STX1AQ16623 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
STX1AQ16623 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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