Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
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