Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.7□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
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SNCBQ16143 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
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