Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZIC1Q15915 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZIC1Q15915 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZIC1Q15915 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZIC1Q15915 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.96□□□□□ -2.26
ZIC1Q15915 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZIC1Q15915 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZIC1Q15915 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZIC1Q15915 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
ZIC1Q15915 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZIC1Q15915 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZIC1Q15915 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZIC1Q15915 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZIC1Q15915 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
ZIC1Q15915 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZIC1Q15915 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZIC1Q15915 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZIC1Q15915 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZIC1Q15915 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZIC1Q15915 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
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