Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC1.22□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
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