Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SF1Q15637 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SF1Q15637 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SF1Q15637 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SF1Q15637 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SF1Q15637 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SF1Q15637 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SF1Q15637 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SF1Q15637 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SF1Q15637 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SF1Q15637 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SF1Q15637 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SF1Q15637 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SF1Q15637 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SF1Q15637 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SF1Q15637 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SF1Q15637 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SF1Q15637 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SF1Q15637 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SF1Q15637 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SF1Q15637 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SF1Q15637 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SF1Q15637 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SF1Q15637 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SF1Q15637 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SF1Q15637 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SF1Q15637 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SF1Q15637 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SF1Q15637 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SF1Q15637 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SF1Q15637 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SF1Q15637 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SF1Q15637 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SF1Q15637 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SF1Q15637 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SF1Q15637 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SF1Q15637 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SF1Q15637 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SF1Q15637 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SF1Q15637 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SF1Q15637 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SF1Q15637 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SF1Q15637 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SF1Q15637 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SF1Q15637 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SF1Q15637 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SF1Q15637 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
SF1Q15637 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SF1Q15637 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SF1Q15637 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
SF1Q15637 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SF1Q15637 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SF1Q15637 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SF1Q15637 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SF1Q15637 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SF1Q15637 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SF1Q15637 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SF1Q15637 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SF1Q15637 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SF1Q15637 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SF1Q15637 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SF1Q15637 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SF1Q15637 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SF1Q15637 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SF1Q15637 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SF1Q15637 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
SF1Q15637 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
SF1Q15637 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
SF1Q15637 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SF1Q15637 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SF1Q15637 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SF1Q15637 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SF1Q15637 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SF1Q15637 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SF1Q15637 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SF1Q15637 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SF1Q15637 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SF1Q15637 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SF1Q15637 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SF1Q15637 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SF1Q15637 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SF1Q15637 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SF1Q15637 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SF1Q15637 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SF1Q15637 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SF1Q15637 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SF1Q15637 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SF1Q15637 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SF1Q15637 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SF1Q15637 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SF1Q15637 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SF1Q15637 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SF1Q15637 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SF1Q15637 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SF1Q15637 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SF1Q15637 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SF1Q15637 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SF1Q15637 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SF1Q15637 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SF1Q15637 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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