Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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SIX1Q15475 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
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SIX1Q15475 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
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SIX1Q15475 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
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SIX1Q15475 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
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SIX1Q15475 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
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SIX1Q15475 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
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SIX1Q15475 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
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SIX1Q15475 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
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SIX1Q15475 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
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SIX1Q15475 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
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