Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PRKD1Q15139 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PRKD1Q15139 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PRKD1Q15139 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PRKD1Q15139 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PRKD1Q15139 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PRKD1Q15139 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PRKD1Q15139 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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PRKD1Q15139 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PRKD1Q15139 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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PRKD1Q15139 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
PRKD1Q15139 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PRKD1Q15139 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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PRKD1Q15139 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PRKD1Q15139 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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PRKD1Q15139 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PRKD1Q15139 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PRKD1Q15139 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
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PRKD1Q15139 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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PRKD1Q15139 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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PRKD1Q15139 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
PRKD1Q15139 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
PRKD1Q15139 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PRKD1Q15139 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
PRKD1Q15139 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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PRKD1Q15139 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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PRKD1Q15139 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PRKD1Q15139 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PRKD1Q15139 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PRKD1Q15139 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PRKD1Q15139 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PRKD1Q15139 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PRKD1Q15139 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
PRKD1Q15139 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PRKD1Q15139 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PRKD1Q15139 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PRKD1Q15139 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PRKD1Q15139 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PRKD1Q15139 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PRKD1Q15139 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PRKD1Q15139 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PRKD1Q15139 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PRKD1Q15139 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PRKD1Q15139 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PRKD1Q15139 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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