Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC1.61□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
BRD3Q15059 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
BRD3Q15059 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
BRD3Q15059 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
BRD3Q15059 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
BRD3Q15059 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
BRD3Q15059 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
BRD3Q15059 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
BRD3Q15059 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
BRD3Q15059 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
BRD3Q15059 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
BRD3Q15059 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
BRD3Q15059 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
BRD3Q15059 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
BRD3Q15059 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
BRD3Q15059 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
BRD3Q15059 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
BRD3Q15059 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
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BRD3Q15059 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
BRD3Q15059 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
BRD3Q15059 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
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BRD3Q15059 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
BRD3Q15059 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
BRD3Q15059 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
BRD3Q15059 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
BRD3Q15059 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
BRD3Q15059 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
BRD3Q15059 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
BRD3Q15059 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
BRD3Q15059 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
BRD3Q15059 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
BRD3Q15059 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
BRD3Q15059 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
BRD3Q15059 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
BRD3Q15059 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
BRD3Q15059 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
BRD3Q15059 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
BRD3Q15059 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
BRD3Q15059 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
BRD3Q15059 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
BRD3Q15059 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
BRD3Q15059 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
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