Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.35□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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