Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HERPUD1Q15011 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HERPUD1Q15011 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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