Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NR1I3Q14994 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NR1I3Q14994 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NR1I3Q14994 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NR1I3Q14994 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NR1I3Q14994 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NR1I3Q14994 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NR1I3Q14994 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NR1I3Q14994 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NR1I3Q14994 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
NR1I3Q14994 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NR1I3Q14994 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NR1I3Q14994 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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