Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.15□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
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