Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC-1.37□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC-1.37□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.38□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC-1.38□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC-1.38□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC-1.39□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-1.39□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC-1.4□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC-1.4□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC-1.41□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC-1.42□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC-1.42□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC-1.43□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
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