Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SCN5AQ14524 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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