Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ITGA9Q13797 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ITGA9Q13797 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ITGA9Q13797 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ITGA9Q13797 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ITGA9Q13797 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ITGA9Q13797 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ITGA9Q13797 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ITGA9Q13797 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ITGA9Q13797 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ITGA9Q13797 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ITGA9Q13797 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ITGA9Q13797 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ITGA9Q13797 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ITGA9Q13797 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ITGA9Q13797 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ITGA9Q13797 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ITGA9Q13797 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ITGA9Q13797 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ITGA9Q13797 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ITGA9Q13797 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ITGA9Q13797 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ITGA9Q13797 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ITGA9Q13797 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ITGA9Q13797 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ITGA9Q13797 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ITGA9Q13797 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
ITGA9Q13797 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
ITGA9Q13797 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ITGA9Q13797 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ITGA9Q13797 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ITGA9Q13797 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ITGA9Q13797 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ITGA9Q13797 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ITGA9Q13797 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ITGA9Q13797 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ITGA9Q13797 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ITGA9Q13797 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ITGA9Q13797 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ITGA9Q13797 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ITGA9Q13797 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ITGA9Q13797 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ITGA9Q13797 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ITGA9Q13797 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ITGA9Q13797 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ITGA9Q13797 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ITGA9Q13797 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ITGA9Q13797 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
ITGA9Q13797 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
ITGA9Q13797 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ITGA9Q13797 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ITGA9Q13797 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ITGA9Q13797 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ITGA9Q13797 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ITGA9Q13797 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ITGA9Q13797 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ITGA9Q13797 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ITGA9Q13797 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ITGA9Q13797 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ITGA9Q13797 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ITGA9Q13797 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ITGA9Q13797 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ITGA9Q13797 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ITGA9Q13797 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ITGA9Q13797 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
ITGA9Q13797 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ITGA9Q13797 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ITGA9Q13797 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ITGA9Q13797 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ITGA9Q13797 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ITGA9Q13797 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ITGA9Q13797 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ITGA9Q13797 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ITGA9Q13797 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ITGA9Q13797 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ITGA9Q13797 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ITGA9Q13797 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ITGA9Q13797 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ITGA9Q13797 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ITGA9Q13797 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ITGA9Q13797 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ITGA9Q13797 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ITGA9Q13797 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ITGA9Q13797 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
ITGA9Q13797 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ITGA9Q13797 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ITGA9Q13797 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ITGA9Q13797 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ITGA9Q13797 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ITGA9Q13797 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ITGA9Q13797 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ITGA9Q13797 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ITGA9Q13797 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ITGA9Q13797 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ITGA9Q13797 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ITGA9Q13797 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ITGA9Q13797 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ITGA9Q13797 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ITGA9Q13797 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ITGA9Q13797 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.4 ms