Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC1.31□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.3□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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