Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PRPF4BQ13523 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PRPF4BQ13523 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PRPF4BQ13523 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PRPF4BQ13523 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PRPF4BQ13523 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PRPF4BQ13523 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PRPF4BQ13523 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PRPF4BQ13523 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PRPF4BQ13523 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PRPF4BQ13523 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PRPF4BQ13523 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PRPF4BQ13523 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PRPF4BQ13523 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PRPF4BQ13523 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PRPF4BQ13523 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PRPF4BQ13523 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PRPF4BQ13523 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PRPF4BQ13523 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PRPF4BQ13523 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PRPF4BQ13523 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PRPF4BQ13523 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PRPF4BQ13523 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PRPF4BQ13523 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PRPF4BQ13523 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PRPF4BQ13523 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
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