Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TUBB3Q13509 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TUBB3Q13509 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TUBB3Q13509 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TUBB3Q13509 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TUBB3Q13509 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TUBB3Q13509 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TUBB3Q13509 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TUBB3Q13509 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TUBB3Q13509 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TUBB3Q13509 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TUBB3Q13509 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
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TUBB3Q13509 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TUBB3Q13509 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TUBB3Q13509 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TUBB3Q13509 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TUBB3Q13509 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TUBB3Q13509 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TUBB3Q13509 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TUBB3Q13509 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TUBB3Q13509 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TUBB3Q13509 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
TUBB3Q13509 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TUBB3Q13509 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TUBB3Q13509 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TUBB3Q13509 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TUBB3Q13509 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TUBB3Q13509 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TUBB3Q13509 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TUBB3Q13509 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TUBB3Q13509 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TUBB3Q13509 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TUBB3Q13509 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TUBB3Q13509 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
TUBB3Q13509 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
TUBB3Q13509 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
TUBB3Q13509 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TUBB3Q13509 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TUBB3Q13509 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TUBB3Q13509 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TUBB3Q13509 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TUBB3Q13509 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
TUBB3Q13509 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TUBB3Q13509 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TUBB3Q13509 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TUBB3Q13509 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TUBB3Q13509 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TUBB3Q13509 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TUBB3Q13509 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
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TUBB3Q13509 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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TUBB3Q13509 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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TUBB3Q13509 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
TUBB3Q13509 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TUBB3Q13509 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TUBB3Q13509 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TUBB3Q13509 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TUBB3Q13509 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
TUBB3Q13509 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TUBB3Q13509 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TUBB3Q13509 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
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TUBB3Q13509 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TUBB3Q13509 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TUBB3Q13509 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TUBB3Q13509 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TUBB3Q13509 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TUBB3Q13509 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TUBB3Q13509 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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