Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.7 ms