Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NME3Q13232 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NME3Q13232 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NME3Q13232 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
NME3Q13232 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
NME3Q13232 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NME3Q13232 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NME3Q13232 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NME3Q13232 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NME3Q13232 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NME3Q13232 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NME3Q13232 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NME3Q13232 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NME3Q13232 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
NME3Q13232 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NME3Q13232 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NME3Q13232 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NME3Q13232 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
NME3Q13232 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
NME3Q13232 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NME3Q13232 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NME3Q13232 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NME3Q13232 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NME3Q13232 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NME3Q13232 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NME3Q13232 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NME3Q13232 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NME3Q13232 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NME3Q13232 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NME3Q13232 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NME3Q13232 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NME3Q13232 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NME3Q13232 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
NME3Q13232 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NME3Q13232 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NME3Q13232 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NME3Q13232 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NME3Q13232 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NME3Q13232 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NME3Q13232 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NME3Q13232 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NME3Q13232 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NME3Q13232 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NME3Q13232 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NME3Q13232 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NME3Q13232 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NME3Q13232 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NME3Q13232 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
NME3Q13232 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NME3Q13232 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NME3Q13232 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NME3Q13232 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NME3Q13232 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NME3Q13232 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NME3Q13232 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NME3Q13232 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NME3Q13232 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
NME3Q13232 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NME3Q13232 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NME3Q13232 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NME3Q13232 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NME3Q13232 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
NME3Q13232 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NME3Q13232 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NME3Q13232 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NME3Q13232 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NME3Q13232 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NME3Q13232 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NME3Q13232 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NME3Q13232 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NME3Q13232 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NME3Q13232 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NME3Q13232 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NME3Q13232 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NME3Q13232 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NME3Q13232 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NME3Q13232 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NME3Q13232 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NME3Q13232 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NME3Q13232 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
NME3Q13232 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
NME3Q13232 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
NME3Q13232 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
NME3Q13232 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
NME3Q13232 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
NME3Q13232 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
NME3Q13232 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC0.81□□□□□ -2.28
NME3Q13232 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
NME3Q13232 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
NME3Q13232 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
NME3Q13232 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
NME3Q13232 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
NME3Q13232 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
NME3Q13232 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
NME3Q13232 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
NME3Q13232 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
NME3Q13232 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
NME3Q13232 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
NME3Q13232 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
NME3Q13232 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
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