Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CBX3Q13185 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
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