Protein–RNA interactions for Protein: Q13136

PPFIA1, Liprin-alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA1Q13136 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
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