Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHAF1BQ13112 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
CHAF1BQ13112 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
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