Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
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