Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GPS1Q13098 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GPS1Q13098 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
GPS1Q13098 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
GPS1Q13098 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
GPS1Q13098 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GPS1Q13098 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GPS1Q13098 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GPS1Q13098 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GPS1Q13098 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GPS1Q13098 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GPS1Q13098 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GPS1Q13098 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GPS1Q13098 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GPS1Q13098 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GPS1Q13098 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GPS1Q13098 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GPS1Q13098 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GPS1Q13098 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
GPS1Q13098 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GPS1Q13098 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GPS1Q13098 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GPS1Q13098 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GPS1Q13098 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GPS1Q13098 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
GPS1Q13098 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
GPS1Q13098 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GPS1Q13098 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GPS1Q13098 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GPS1Q13098 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GPS1Q13098 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GPS1Q13098 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GPS1Q13098 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GPS1Q13098 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
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