Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC0.46□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.44□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC0.43□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC0.41□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
MRPL28Q13084 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
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