Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.2 ms