Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRAF2Q12933 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRAF2Q12933 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRAF2Q12933 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
TRAF2Q12933 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRAF2Q12933 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRAF2Q12933 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRAF2Q12933 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRAF2Q12933 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRAF2Q12933 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRAF2Q12933 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
TRAF2Q12933 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRAF2Q12933 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRAF2Q12933 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRAF2Q12933 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRAF2Q12933 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRAF2Q12933 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRAF2Q12933 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRAF2Q12933 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 202.1 ms